菌落作為微粒會按空氣的方向和速度運動，因此控制氣流的形式具有重要的意義，氣流的控制應(yīng)該是兩個層次的：一個是總體的，一個是局部的。總體控制即控制手術(shù)部內(nèi)各房間，即手術(shù)室和其相鄰的房間之間的運動。氣流要依手術(shù)部的布置而設(shè)計，有一個重要的原則是：氣流要從最潔凈的房間流向次潔凈的房間，因此氣流必須由手術(shù)室流向潔凈走道,確保污染物不會入侵,按實際經(jīng)驗, I級潔凈手術(shù)室應(yīng)保持25Pa正壓, II級潔凈手術(shù)室應(yīng)保持20Pa正壓, III級潔凈手術(shù)室應(yīng)保持15Pa正壓, IV級潔凈手術(shù)室應(yīng)保持10Pa正壓,潔凈走道應(yīng)保持5~10Pa正壓,當手術(shù)室需要負壓時應(yīng)單獨設(shè)計,建議安裝壓差傳感器以控制手術(shù)室內(nèi)的壓差,手術(shù)室的地板,墻身,天花板門都必須絕對密封,特殊手術(shù)室也可按正負壓轉(zhuǎn)換設(shè)計,當發(fā)生醫(yī)療事故時,可馬上將手術(shù)室由正壓轉(zhuǎn)為負壓,避免污染室外環(huán)境。

考慮到潔凈手術(shù)部的保障體系特點和我國國情,對于凈化空調(diào)系統(tǒng), 我國的《醫(yī)院潔凈手術(shù)部建設(shè)標準》強調(diào)：
（1）I,II級潔凈手術(shù)室采用獨立設(shè)置的凈化空調(diào)機組,III,IV級潔凈手術(shù)室允許2~3間合用1個系統(tǒng)。
（2）手術(shù)部中的潔凈手術(shù)室與輔助用房分開設(shè)置空調(diào)系統(tǒng)。
（3）應(yīng)設(shè)置獨立的新風系統(tǒng)。
（4）整個手術(shù)部應(yīng)始終處于受控狀態(tài),不能因某個手術(shù)室停開而影響整個手術(shù)部有序的梯度壓力分布,否則會破壞各室之間的正壓氣流的定向流動,引起交叉感染或污染室內(nèi)環(huán)境。